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提速近10倍！基于深度学习的全基因组选择新方法来了******

　　近日，中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用，将助力深度学习在全基因组选择中的应用，为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物（Molecular Plant）》上。

　　全基因组选择作为新一代育种技术，通过构建预测模型，根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择，从而缩短育种世代间隔，加快育种进程，节约成本，推动现代育种向精准化和高效化方向发展。

　　统计模型作为全基因组选择的核心，极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型，难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。

　　相较于传统模型，非线性模型（如深度网络神经）具备分析复杂非加性效应的能力，人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机，深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。

　　该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料，通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。

　　与其他五种主流预测方法相比，该方法有以下优点： 可以利用多组学数据开展全基因组预测；算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构，可以有效降低模型错误率，提高运行速度；预测精度稳健，在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当，在大规模数据集上预测优势更加明显；计算时间与传统方法相近，比已有深度学习方法提速近10倍；超参数调整对用户更加友好。

　　该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。

学术支持

中国农业科学院作物科学研究所

记者

宋雅娟

青岛：厉行节约 边角料“变废为宝”******

　　光明日报记者 刘艳杰 光明日报通讯员 朱天麒

　　午餐时间马上到了，青岛市机关食堂冷菜班组的师傅马圣虎连忙将今天的特色小菜“凉拌香菜根”端到了取餐台。

　　“食堂每天要切配各种蔬菜，会产生大量的芹菜叶、白菜根、香菜根、萝卜尾等边角料，扔掉了怪可惜。”马圣虎告诉记者，冷菜班组的师傅们想办法“变废为宝”，每天将切下的根、茎、叶洗净，拌上盐或酱油加辣椒、糖、花椒等调味品，制成一道道精美小菜。美味下饭的小菜不仅深受就餐人员的欢迎，而且减少了原材料的浪费。

　　将边角料“吃干榨净”是青岛市机关食堂厉行节约、反对浪费的一个缩影。

　　据了解，为制止餐饮浪费行为，青岛市成立了反食品浪费工作领导小组，将机关食堂反食品浪费纳入年度重点工作，编制了《机关食堂管理服务标准化手册》，对食材采购、储存加工、餐厨垃圾处理等全流程进行规范。

　　“我们的工作重点是实施规范化管理、建设数字厨房。”青岛市机关事务服务中心党组成员、副主任周先胜介绍，他们把机关餐饮工作全流程分解为94个标准微视频，将每一项工作流程细化和量化。通过标准化食堂建设，达到源头管控标准化、菜品制作标准化、出品品质标准化，实现成本降低、效率提高、品质提升。

　　通过动态大数据进行后厨精细化管理也是青岛机关食堂厉行节约的重要手段之一。比如，每个餐厅都会根据人数准备食材数量，做到“按需补餐”。尤其在制作素菜的时候，都是一餐盒一餐盒地出菜，这样不仅能保持菜品的质量和口感，还能减少剩余原料的产生。

　　在青岛市机关食堂的走廊、墙壁上，一张张厉行节约、反对浪费的宣传海报迎面而来，甚至每张餐桌上，都摆放着“光盘行动”的提示牌，随时提醒就餐者不要浪费食物。

　　通过持续的宣传督导，文明节俭用餐成为每个人的自觉行动。在青岛市机关食堂的餐具回收区，反食品浪费督导员告诉记者，“光盘行动”实施以来，就餐者基本都能做到盆干碗净，餐余垃圾减少了一半。而通过食材的充分利用，制餐区的餐厨垃圾总量也下降了35%。

　　此外，2022年，青岛市已将机关食堂反食品浪费工作成效列为全市公共机构节约能源资源考核和节约型机关创建内容，并组织开展市、区两级机关食堂反食品浪费工作成效评估督查，一方面推动机关食堂反食品浪费工作再上新台阶，另一方面也督促广大干部职工养成绿色低碳的健康生活方式。

　　《光明日报》（ 2023年01月11日 04版）

　　（文图：赵筱尘 巫邓炎）